磁珠法核酸提取是现在常用的DNA提取手段,它有着检测灵敏度高、可自动化操作、安全且快速等特点,在生物检测中得到了广泛应用。但是在核酸提取过程中,经常也会有这种问题出现,今天慧庆小编就为大家介绍磁珠法核酸提取常见的问题及解决办法。
磁珠法核酸提取常见的问题及解决办法
1、裂解效果不好
出现这种情况,多数属由于裂解液出现问题导致的。有人会想要用增加裂解液使用量的方式来解决,但是在磁珠法核酸提取过程中,随着裂解液体积的增大,磁珠与核酸碰撞几率降低,磁珠吸附核酸效率降低,可能导致核酸提取量降低、核酸提取纯度降低等问题。增加裂解液使用量带来的负面影响往往大于正面。
如果裂解效果不好,可以调整裂解液的配方、裂解方式、裂解时间或是减少样品量等来进行解决。
2、核酸降解
出现这种情况多数原因是由于样品的反复冻融,其次也可能是由于在提取过程中剪切力、磁珠表面不均匀、洗脱温度过高和提取流程时间过长导致的。解决办法就是避免样品反复冻融,以及操作过程中出现的问题。
3、核酸纯度不高
核酸提取纯度不高,主要污染原因为蛋白及(或)盐类残留。可在提取过程中加入蛋白酶K降解样品中的蛋白,减少蛋白残留污染,同时用高浓度有机溶剂对核酸进行清洗,减少盐残留对酶活的抑制。
4、提取的核酸得率低
将样品量与试剂配比控制在合理的范围内,避免超过裂解能力。其次在洗脱的步骤,使用足量的洗脱液洗脱并充分混匀,避免有团块残存;实验耗材要匹配,如不同的吸附柱或磁珠的核酸吸附能力不同,也会影响核酸的得率。
5、磁珠结团
磁珠结团是核酸提取过程中经常遇到的现象,尤其手工操作时,这是由磁珠本身特性和磁珠所处试剂环境两方面造成的,有些磁珠不仅在全血DNA提取过程中会结团,其他的样本也同样会结团,其实结团现象可以用来提前预判实验结果,结团往往是吸附了大量核酸,如果哪次实验没有结团,本次的实验结果或许会不太好,不过也不能一概而论,杂质太多也是引起磁珠结团的原因。通过修改试剂配方,优化试剂用量,可以改善磁珠的结团现象,这就需要对各种参数进行调整。
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