磁珠法核酸提取的提取速度快、操作简单方便,被生物实验室和医学机构广泛使用。但是偶尔在核酸提取过程中会有核酸提取得率低的情况,这对于核酸检测结果有很大的影响,出现这种情况的原因是什么呢?接下来慧庆小编就为大家介绍磁珠法核酸提取得率低的原因和解决办法。
磁珠法核酸提取得率低的原因和解决办法
1、裂解不充分
原因:提取核酸时,需要使用裂解液让细胞进行裂解,裂解后的细胞会释放出核酸,但是由于样本的类型复杂且多变,因此不同样本的裂解难易程度也会有区别。如果裂解不充分,细胞释放出来的核酸有限,即使生物磁珠的吸附能力很强,也很难有比较高的得率。
解决办法:针对裂解不充分问题,建议通过提高胍盐浓度以及表面活性剂浓度的方式,来增加裂解液的裂解能力。这是由于胍盐和表面活性剂能够破坏蛋白的高级结构,促进膜蛋白的变性,使得细胞膜破裂。
2、结合能力不足
原因:结合能力不足通常有两方面的原因,一是由于生物磁珠的问题导致,比如采用的生物磁珠比表面积太小,功能基团比较少,从而导致磁珠的核酸吸附能力变弱;另外一个原因是结合缓冲液的结合能力比较弱。
解决办法:如果是磁珠的问题导致,建议选择比表面积大且功能基团多的生物磁珠,通常情况下磁珠的粒径越小,比表面积越大,但是同时磁相应也会偏弱,所以选择磁珠需要根据实际的样本情况来定。
如果是结合缓冲液的问题,那么可以通过提高醇的比例来增强结合能力,同时,也要提高离液盐(胍盐、钠盐等)的浓度来促进核酸与磁珠的结合。
3、洗脱不充分
原因:有时候明明裂解结合液还有各种条件都已经优化得很好了,但是提取到的核酸得率依然不高,这种情况有可能是磁珠虽然与核酸结合了,但是洗脱不充分,与磁珠结合的核酸没有被洗脱下来。
解决办法:这种情况建议进行二次洗脱增加产量或提高洗脱体积。
除了以上三种因素以外,得率的高低还与样本以及个体的差异有关,不同的样品核酸含量差异也比较大。
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