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如何更好的获得细菌基因组DNA/RNA?慧庆实验成果分析

时间:2023-09-14 15:59:36 来源:洛阳慧庆生物科技有限公司
  核酸是重要的生物信息分子,是分子生物学的主要研究对象之一。利用核酸提取试剂提取细菌基因组DNA/RNA可用于PCR扩增、分子杂交、核酸检测分析、基因突变检测和测序等,而核酸提取的质量对实验结果的准确性影响很大。那么如何更好的获得细菌基因组DNA/RNA?慧庆生物结合具体的实验成果为大家分析一下。
  

  实验论证:如何更好的获得细菌基因组DNA/RNA

  
  1.实验目的
  
  用自动核酸提取纯化仪能够成功提取细菌基因组DNA,并获得较好的电泳条带。
  
  2.实验仪器及试剂
  
  仪器:台式离心机(SIGMA)、超微量分光光度计(Q5000)、电泳仪(北京六一仪器厂,DYY-7C型)、自动核酸提取仪(LJbio32H)
  
  试剂:细菌基因组DNA提取试剂盒(磁珠法、预分装)
  
  3.实验方法
  
  (1)样本处理:取过夜培养的细菌100~1000 μL(细胞数为108-109)至1.5 mL 离心管中10000g离心2min,吸弃上清,再加入200 μL EB重悬菌体备用。
  
  (2)按照试剂盒说明书手工操作,提取细菌基因组DNA。
  
  (3)优化自动核酸提取纯化仪的上机参数(①65℃裂解,8min ②65℃裂解,10min ③室温裂解,10min)。
  
  (4)用超微量分光光度计测量提取的DNA,并进行电泳检测。
  
  4.实验结果
  
  (1)在超微量分光光度计上用EB润洗点点空白,取1-2 μl的洗脱产物检测,记录各个波长的吸光度,得到的数据如下:
  
  表1  核酸提取纯化仪提取结果
  

序号

A260/A280

A260/A230

Conc(ng/μL)

备注

1.

1.98

1.51

186.6

658min4

2.

1.95

1.42

183.7

3.

1.92

1.39

163.3

6510min4

 

4.

2.02

1.69

150.1

5.

1.76

0.95

176.9

室温10min4

 

6.

1.89

1.24

380.6

  备注:加底纹的电泳
  
  (2)在1%的琼脂糖凝胶上加入6μL洗脱的基因组DNA/扩增产物/DNA Marker进行电泳,结果如下:
  电泳结果
  M:DL2000Ladder
  
  1:65℃裂解,8min;2-3: 65℃裂解,10min;4-5: 常温10min
  
  5.分析与讨论
  
  (1)由浓度测量结果和产物电泳图可知,三种提取条件下纯度与纯度稍有差异,室温裂解条件下,电泳结果点样孔有滞留,裂解效果比其他两种稍差,但也有明显DNA带与两条RNA条带。
  
  (2)电泳图编号4 的DNA条带略暗,与测量结果也能对应起来,分析原因是提取所用耗材此孔位对应的磁棒套稍长一点,仪器提取过程中磁棒套搅拌过程中影响其裂解效果,导致此孔提取核酸测量值与电泳结果稍差。
  
  (3)对比三种程序提取效果,65℃裂解8min的测量值较均一,重复性较好,DNA条带最亮。
  
  如何更好的获得细菌基因组DNA/RNA?看了以上的实验过程以及结果分析,相信大家已经有了更深入的认识。洛阳慧庆生物生产的细菌基因组DNA提取试剂(磁珠法)核酸提取成功率更高、价格适中,受到高校及科研单位用户的好评。如您有相关疑问或者采购需求,请留言或者电话联系我们。
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